Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPN13Q12923 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN13Q12923 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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