Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMARCB1Q12824 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCB1Q12824 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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