Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC173Q0VFZ6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC173Q0VFZ6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms