Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE4CQ08493 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms