Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGM3Q08188 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms