Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PSME1Q06323 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PSME1Q06323 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms