Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNB3Q05901 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms