Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms