Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GBE1Q04446 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms