Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KCNC4Q03721 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms