Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PPARDQ03181 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PPARDQ03181 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms