Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNA1P78396 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNA1P78396 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms