Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HBBP68871 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HBBP68871 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HBBP68871 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HBBP68871 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HBBP68871 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HBBP68871 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HBBP68871 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HBBP68871 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HBBP68871 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HBBP68871 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HBBP68871 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms