Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P63121 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P63121 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms