Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTBP60709 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTBP60709 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTBP60709 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms