Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHMP4BP1P59074 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms