Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJA9P57773 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJA9P57773 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJA9P57773 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA9P57773 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA9P57773 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA9P57773 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA9P57773 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA9P57773 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms