Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF1P55201 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRPF1P55201 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms