Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EPHB4P54760 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms