Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms