Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E1P51965 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms