Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA2P51531 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA2P51531 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms