Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK2P49760 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLK2P49760 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLK2P49760 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK2P49760 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK2P49760 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK2P49760 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK2P49760 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms