Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPFP49454 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPFP49454 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPFP49454 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPFP49454 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPFP49454 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPFP49454 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPFP49454 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPFP49454 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms