Protein–RNA interactions for Protein: P48634

PRRC2A, Protein PRRC2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2AP48634 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRRC2AP48634 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC2AP48634 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms