Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCLCP48506 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCLCP48506 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCLCP48506 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCLCP48506 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GCLCP48506 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCLCP48506 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCLCP48506 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCLCP48506 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLCP48506 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLCP48506 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCLCP48506 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms