Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA2P47869 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA2P47869 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms