Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPGP40121 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPGP40121 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPGP40121 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPGP40121 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPGP40121 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPGP40121 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPGP40121 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPGP40121 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPGP40121 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAPGP40121 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPGP40121 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPGP40121 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPGP40121 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPGP40121 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPGP40121 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPGP40121 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAPGP40121 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms