Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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