Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMOD1P29536 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMOD1P29536 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms