Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB2P29033 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB2P29033 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB2P29033 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB2P29033 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB2P29033 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB2P29033 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB2P29033 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms