Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD34P28906 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD34P28906 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD34P28906 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD34P28906 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD34P28906 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CD34P28906 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD34P28906 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms