Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB9P28065 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms