Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PLNP26678 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PLNP26678 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PLNP26678 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PLNP26678 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PLNP26678 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PLNP26678 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms