Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2B4P23634 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms