Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALB2P22676 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALB2P22676 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CALB2P22676 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALB2P22676 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALB2P22676 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALB2P22676 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALB2P22676 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALB2P22676 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALB2P22676 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CALB2P22676 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CALB2P22676 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CALB2P22676 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CALB2P22676 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALB2P22676 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALB2P22676 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALB2P22676 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALB2P22676 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALB2P22676 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALB2P22676 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALB2P22676 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALB2P22676 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CALB2P22676 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms