Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MDKP21741 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MDKP21741 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MDKP21741 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MDKP21741 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MDKP21741 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MDKP21741 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MDKP21741 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MDKP21741 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MDKP21741 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MDKP21741 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDKP21741 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDKP21741 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDKP21741 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDKP21741 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDKP21741 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDKP21741 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDKP21741 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDKP21741 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MDKP21741 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms