Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRB1P18505 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRB1P18505 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRB1P18505 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRB1P18505 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRB1P18505 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRB1P18505 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRB1P18505 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRB1P18505 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRB1P18505 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRB1P18505 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms