Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRAP18433 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRAP18433 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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