Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAPN2P17655 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms