Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFTRP13569 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CFTRP13569 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CFTRP13569 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CFTRP13569 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CFTRP13569 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CFTRP13569 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CFTRP13569 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CFTRP13569 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CFTRP13569 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CFTRP13569 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFTRP13569 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFTRP13569 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFTRP13569 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFTRP13569 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFTRP13569 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CFTRP13569 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFTRP13569 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFTRP13569 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFTRP13569 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFTRP13569 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFTRP13569 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFTRP13569 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFTRP13569 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFTRP13569 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFTRP13569 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFTRP13569 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFTRP13569 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFTRP13569 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFTRP13569 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFTRP13569 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFTRP13569 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFTRP13569 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFTRP13569 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFTRP13569 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFTRP13569 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CFTRP13569 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFTRP13569 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFTRP13569 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CFTRP13569 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFTRP13569 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFTRP13569 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms