Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RLBP1P12271 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms