Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL3P10147 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL3P10147 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL3P10147 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL3P10147 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCL3P10147 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms