Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMIGD3P0DMS9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms