Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P0C879 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P0C879 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P0C879 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms