Protein–RNA interactions for Protein: P09661

SNRPA1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPA1P09661 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRPA1P09661 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms