Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM2P07951 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM2P07951 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM2P07951 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM2P07951 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM2P07951 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM2P07951 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM2P07951 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM2P07951 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM2P07951 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM2P07951 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM2P07951 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM2P07951 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms