Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CYBBP04839 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYBBP04839 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYBBP04839 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYBBP04839 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYBBP04839 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYBBP04839 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYBBP04839 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYBBP04839 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms