Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGAP02671 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGAP02671 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGAP02671 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGAP02671 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FGAP02671 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FGAP02671 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGAP02671 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGAP02671 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms