Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLDN9O95484 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLDN9O95484 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms